无症状的肝囊肿一般无需处理；但症状明显，囊肿较大者需要治疗。以往多采用肝切除或切除部分囊壁，将囊液引流入腹腔或进行腹腔引流。在超声或ＣＴ导向下穿刺抽液，然后注入无水酒精治疗肝囊肿。经治疗，部分患者有效，但复发率很高。肝囊肿的囊腔内注入无水酒精能使囊壁产生慢性炎症，使囊壁内皮细胞失活，停止分泌而阻止囊肿液再形成，因此称作肝囊肿穿刺硬化治疗。主要适用于有临床症状，且直径大于5cm（也有认为3～4cm）的单发或多发性囊肿；囊肿虽小，但症状明显者也可治疗。禁忌证主要为不能合作者以及有明显出血倾向者。同时需谨慎除外肝包囊虫病，以免穿刺导致腹腔内播散。较小的囊肿可一次抽尽囊液，较大的可分次抽液，每次抽液量500～1 000ml，无水酒精的注入量为抽出量的1/5～1/2，也有认为以25%为宜，但一般一次注入量不超过100～150ml。1～2周后可再次治疗。对囊肿合并感染者，先给予抗生素，待感染控制后再予无水酒精治疗。术后可能有肝区疼痛、烧灼感，但如在给无水酒精前先注入2%利多卡因5～10 ml，以及在拔针过程中边退针边注射少量利多卡因可减轻症状。此外， 选择有部分正常肝组织处进针，可避免穿刺后囊肿液漏入腹腔的可能性。